MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio alginolyticus NBRC 15630 = ATCC 17749 chromosome 1

Total Repeats: 54392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022349	CGAG	2	8	36	43	25 %	0 %	50 %	25 %	543941915
2	NC_022349	TTG	2	6	110	115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941915
3	NC_022349	TTG	2	6	209	214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941915
4	NC_022349	GGGC	2	8	261	268	0 %	0 %	75 %	25 %	543941915
5	NC_022349	GCA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941915
6	NC_022349	GAA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941915
7	NC_022349	CGC	2	6	298	303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543941915
8	NC_022349	CTT	2	6	311	316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543941915
9	NC_022349	T	6	6	315	320	0 %	100 %	0 %	0 %	543941915
10	NC_022349	TC	3	6	364	369	0 %	50 %	0 %	50 %	543941915
11	NC_022349	AGA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941915
12	NC_022349	AGTT	2	8	506	513	25 %	50 %	25 %	0 %	543941915
13	NC_022349	ATG	2	6	539	544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941915
14	NC_022349	TGC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543941915
15	NC_022349	CAT	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941915
16	NC_022349	TGG	2	6	848	853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941915
17	NC_022349	CAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941915
18	NC_022349	GCA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941915
19	NC_022349	GTT	2	6	993	998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941915
20	NC_022349	GCG	2	6	1018	1023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941915
21	NC_022349	TA	3	6	1111	1116	50 %	50 %	0 %	0 %	543941915
22	NC_022349	GC	3	6	1154	1159	0 %	0 %	50 %	50 %	543941915
23	NC_022349	TTAC	2	8	1261	1268	25 %	50 %	0 %	25 %	543941915
24	NC_022349	ATC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941915
25	NC_022349	CAT	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941915
26	NC_022349	ATTG	2	8	1352	1359	25 %	50 %	25 %	0 %	543941916
27	NC_022349	TGA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941916
28	NC_022349	TGC	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543941916
29	NC_022349	CAG	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941916
30	NC_022349	T	6	6	1684	1689	0 %	100 %	0 %	0 %	543941916
31	NC_022349	CAT	2	6	1692	1697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941916
32	NC_022349	GCTG	2	8	1887	1894	0 %	25 %	50 %	25 %	543941916
33	NC_022349	CAG	2	6	1940	1945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941916
34	NC_022349	GTG	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941916
35	NC_022349	GTG	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941916
36	NC_022349	GGT	2	6	2232	2237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941916
37	NC_022349	AGC	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941916
38	NC_022349	ACG	2	6	2340	2345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941916
39	NC_022349	TCA	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941916
40	NC_022349	TGAG	2	8	2452	2459	25 %	25 %	50 %	0 %	543941916
41	NC_022349	TGTT	2	8	2506	2513	0 %	75 %	25 %	0 %	543941916
42	NC_022349	GTG	2	6	2584	2589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941916
43	NC_022349	CG	4	8	2634	2641	0 %	0 %	50 %	50 %	543941916
44	NC_022349	CAA	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941916
45	NC_022349	AAC	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941916
46	NC_022349	TGG	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941916
47	NC_022349	GCTG	2	8	2885	2892	0 %	25 %	50 %	25 %	543941916
48	NC_022349	GCG	2	6	2926	2931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941916
49	NC_022349	CAA	2	6	2996	3001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941916
50	NC_022349	GTTT	2	8	3086	3093	0 %	75 %	25 %	0 %	543941917
51	NC_022349	T	6	6	3188	3193	0 %	100 %	0 %	0 %	543941917
52	NC_022349	GGC	2	6	3289	3294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941918
53	NC_022349	ATT	2	6	3355	3360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543941918
54	NC_022349	ATG	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941918
55	NC_022349	CAA	2	6	3481	3486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941918
56	NC_022349	TTC	2	6	3495	3500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543941918
57	NC_022349	CATT	2	8	3524	3531	25 %	50 %	0 %	25 %	543941918
58	NC_022349	GCGAA	2	10	3532	3541	40 %	0 %	40 %	20 %	543941918
59	NC_022349	TTG	2	6	3607	3612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941918
60	NC_022349	TG	3	6	3650	3655	0 %	50 %	50 %	0 %	543941918
61	NC_022349	AGC	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941918
62	NC_022349	ATAC	2	8	3766	3773	50 %	25 %	0 %	25 %	543941918
63	NC_022349	AAT	2	6	3780	3785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543941918
64	NC_022349	GAA	3	9	3854	3862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941919
65	NC_022349	GCG	2	6	3891	3896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941919
66	NC_022349	CATT	2	8	3910	3917	25 %	50 %	0 %	25 %	543941919
67	NC_022349	GAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941919
68	NC_022349	TTCTG	2	10	4082	4091	0 %	60 %	20 %	20 %	543941919
69	NC_022349	GCG	2	6	4092	4097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941919
70	NC_022349	AGA	2	6	4101	4106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941919
71	NC_022349	CGG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941919
72	NC_022349	GAC	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941919
73	NC_022349	CA	3	6	4144	4149	50 %	0 %	0 %	50 %	543941919
74	NC_022349	GGT	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941919
75	NC_022349	ATG	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941919
76	NC_022349	TG	3	6	4257	4262	0 %	50 %	50 %	0 %	543941919
77	NC_022349	CGG	2	6	4327	4332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941919
78	NC_022349	TCGTA	2	10	4354	4363	20 %	40 %	20 %	20 %	543941919
79	NC_022349	AAAG	2	8	4369	4376	75 %	0 %	25 %	0 %	543941919
80	NC_022349	AAG	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941919
81	NC_022349	AGAA	2	8	4470	4477	75 %	0 %	25 %	0 %	543941919
82	NC_022349	CGTT	2	8	4480	4487	0 %	50 %	25 %	25 %	543941919
83	NC_022349	TAC	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941919
84	NC_022349	GAT	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941919
85	NC_022349	TGA	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941919
86	NC_022349	AAG	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941919
87	NC_022349	GTG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941920
88	NC_022349	ACA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941920
89	NC_022349	TGT	2	6	4911	4916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941920
90	NC_022349	CTC	2	6	4958	4963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543941920
91	NC_022349	AG	3	6	4980	4985	50 %	0 %	50 %	0 %	543941920
92	NC_022349	TGG	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941920
93	NC_022349	CAA	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941920
94	NC_022349	AATC	2	8	5279	5286	50 %	25 %	0 %	25 %	543941920
95	NC_022349	GCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941920
96	NC_022349	AGA	2	6	5394	5399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941920
97	NC_022349	TC	3	6	5424	5429	0 %	50 %	0 %	50 %	543941920
98	NC_022349	TCG	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543941920
99	NC_022349	ATC	3	9	5533	5541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941920
100	NC_022349	GC	3	6	5662	5667	0 %	0 %	50 %	50 %	543941920
101	NC_022349	TGA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941920
102	NC_022349	TTC	2	6	5768	5773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543941920
103	NC_022349	TG	3	6	5793	5798	0 %	50 %	50 %	0 %	543941920
104	NC_022349	CAA	2	6	5901	5906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941921
105	NC_022349	G	6	6	5962	5967	0 %	0 %	100 %	0 %	543941921
106	NC_022349	TTGG	2	8	5979	5986	0 %	50 %	50 %	0 %	543941921
107	NC_022349	TGT	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941921
108	NC_022349	GC	3	6	6037	6042	0 %	0 %	50 %	50 %	543941921
109	NC_022349	CGCTG	2	10	6044	6053	0 %	20 %	40 %	40 %	543941921
110	NC_022349	AAC	2	6	6061	6066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941921
111	NC_022349	GTA	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941921
112	NC_022349	AG	3	6	6221	6226	50 %	0 %	50 %	0 %	543941921
113	NC_022349	ATC	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941921
114	NC_022349	AGT	2	6	6272	6277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941921
115	NC_022349	TTG	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941921
116	NC_022349	GAT	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941921
117	NC_022349	TTG	2	6	6487	6492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941921
118	NC_022349	ATG	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941921
119	NC_022349	CTT	2	6	6517	6522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543941921
120	NC_022349	GAT	3	9	6552	6560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941921
121	NC_022349	GGC	2	6	6591	6596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941921
122	NC_022349	GGTTA	2	10	6652	6661	20 %	40 %	40 %	0 %	543941921
123	NC_022349	GGC	2	6	6674	6679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941921
124	NC_022349	TTG	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543941921
125	NC_022349	TGA	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941921
126	NC_022349	TGG	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941921
127	NC_022349	GCA	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941921
128	NC_022349	CTA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941921
129	NC_022349	TCA	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941921
130	NC_022349	AGT	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941922
131	NC_022349	CT	3	6	7398	7403	0 %	50 %	0 %	50 %	543941922
132	NC_022349	TA	3	6	7446	7451	50 %	50 %	0 %	0 %	543941922
133	NC_022349	ACC	2	6	7498	7503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543941922
134	NC_022349	ACA	2	6	7568	7573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941923
135	NC_022349	CAG	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941923
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138	NC_022349	GCTT	2	8	7648	7655	0 %	50 %	25 %	25 %	543941923
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141	NC_022349	T	6	6	7758	7763	0 %	100 %	0 %	0 %	543941923
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156	NC_022349	GAG	2	6	8374	8379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543941923
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231	NC_022349	TTGA	2	8	13721	13728	25 %	50 %	25 %	0 %	543941928
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249	NC_022349	GGT	2	6	15049	15054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941929
250	NC_022349	GGT	2	6	15163	15168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941929
251	NC_022349	CTAT	2	8	15275	15282	25 %	50 %	0 %	25 %	543941929
252	NC_022349	GAAAAC	2	12	15316	15327	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543941929
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257	NC_022349	TAC	2	6	15649	15654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941929
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259	NC_022349	TGA	2	6	15717	15722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941929
260	NC_022349	CCA	2	6	15750	15755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543941929
261	NC_022349	CGC	2	6	15783	15788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543941929
262	NC_022349	AG	3	6	15802	15807	50 %	0 %	50 %	0 %	543941929
263	NC_022349	CAA	2	6	15827	15832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941929
264	NC_022349	ATGG	2	8	15871	15878	25 %	25 %	50 %	0 %	543941929
265	NC_022349	CTA	2	6	15889	15894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941929
266	NC_022349	ATT	2	6	16065	16070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543941929
267	NC_022349	GCT	2	6	16096	16101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543941929
268	NC_022349	TGA	2	6	16142	16147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941929
269	NC_022349	AAG	2	6	16175	16180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941929
270	NC_022349	TGG	2	6	16329	16334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941929
271	NC_022349	CAGG	2	8	16336	16343	25 %	0 %	50 %	25 %	543941929
272	NC_022349	AGA	2	6	16374	16379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941929
273	NC_022349	GAAC	2	8	16383	16390	50 %	0 %	25 %	25 %	543941929
274	NC_022349	GGT	2	6	16486	16491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941929
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276	NC_022349	GGC	2	6	16519	16524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941929
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280	NC_022349	AGAT	2	8	16604	16611	50 %	25 %	25 %	0 %	543941929
281	NC_022349	A	6	6	16619	16624	100 %	0 %	0 %	0 %	543941929
282	NC_022349	GGT	2	6	16717	16722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941929
283	NC_022349	TGA	2	6	16779	16784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941929
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287	NC_022349	GGC	2	6	16884	16889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941929
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290	NC_022349	GGC	2	6	17121	17126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941929
291	NC_022349	TGG	2	6	17187	17192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941929
292	NC_022349	TTGGT	2	10	17198	17207	0 %	60 %	40 %	0 %	543941929
293	NC_022349	TAT	2	6	17208	17213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543941929
294	NC_022349	TGA	2	6	17381	17386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941929
295	NC_022349	TTGT	2	8	17509	17516	0 %	75 %	25 %	0 %	543941929
296	NC_022349	GATT	2	8	17534	17541	25 %	50 %	25 %	0 %	543941929
297	NC_022349	GC	3	6	17861	17866	0 %	0 %	50 %	50 %	543941930
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299	NC_022349	ACAT	2	8	17899	17906	50 %	25 %	0 %	25 %	543941930
300	NC_022349	GCG	2	6	17951	17956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543941930
301	NC_022349	ACA	2	6	17980	17985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941930
302	NC_022349	GTG	2	6	18125	18130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941930
303	NC_022349	TGA	2	6	18211	18216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941930
304	NC_022349	AGC	2	6	18228	18233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941930
305	NC_022349	AAT	2	6	18265	18270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543941930
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307	NC_022349	TGA	2	6	18620	18625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941931
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323	NC_022349	ATCTG	2	10	19581	19590	20 %	40 %	20 %	20 %	543941932
324	NC_022349	CAA	2	6	19597	19602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941932
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329	NC_022349	AG	3	6	19818	19823	50 %	0 %	50 %	0 %	543941932
330	NC_022349	TAAA	2	8	19891	19898	75 %	25 %	0 %	0 %	543941932
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336	NC_022349	ACG	2	6	20210	20215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543941933
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374	NC_022349	GTG	2	6	23037	23042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543941934
375	NC_022349	TTA	2	6	23067	23072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543941934
376	NC_022349	TGCA	2	8	23130	23137	25 %	25 %	25 %	25 %	543941934
377	NC_022349	TCG	2	6	23193	23198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543941934
378	NC_022349	CAA	2	6	23334	23339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543941934
379	NC_022349	CCA	2	6	23396	23401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543941934
380	NC_022349	TC	3	6	23420	23425	0 %	50 %	0 %	50 %	543941934
381	NC_022349	AACA	2	8	23541	23548	75 %	0 %	0 %	25 %	543941934
382	NC_022349	AGA	2	6	23590	23595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941934
383	NC_022349	GTTTG	2	10	23602	23611	0 %	60 %	40 %	0 %	543941934
384	NC_022349	CGTT	2	8	23617	23624	0 %	50 %	25 %	25 %	543941934
385	NC_022349	GAA	2	6	23645	23650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543941934
386	NC_022349	ACT	2	6	23680	23685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543941934
387	NC_022349	TAA	2	6	23721	23726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543941934
388	NC_022349	GATG	2	8	23756	23763	25 %	25 %	50 %	0 %	543941934
389	NC_022349	GAT	2	6	23783	23788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543941934
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